CGIによっては、設置場所の絶対パス情報が必要な場合があります。
仮にFTPユーザー名がexampleの場合、ホームディレクトリまでの絶対パスは、
/home/example/www
です。そのため、例えば、
http://www.example.com/cgi/bbs.cgi
上記URLで参照されるCGIスクリプトの絶対パスは、
/home/example/www/cgi/bbs.cgi
であるということになります。